精通遗传发SCI的大神们,请教突变位点致病性分析如何做?
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我没发过专门研究位点致病性的paper,我就简介一下我在分析位点致病性一般咋做的吧,可能有点不对题,给您写参考吧。 一、位点MAF值(分布频率)分析,排除良性变异SNP 通过dbSNP数据库、ExAC数据库、ESP数据库、千人基因数据库等先排除良性变异。 二、检索OMIM数据库、Swiss-var数据库、HGMD数据库 ...
请问OMIM如何使用? - 知乎
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OMIM 提供ACMG 致病性判断的数据支持。 OMIM数据库对临床医生的实践指导 增加信心,结合使用生物信息学数据库的结构化方法有可能使学生适应新的临床情况和患者。 文献参考 [1] 甄一松, 谢攀, 史海波,等. 在线人类孟德尔遗传数据库 (OMIM) [J].
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患有寻常型鱼鳞病会遗传给后代吗? - 知乎
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会。寻常性鱼鳞病(OMIM:146700)是由于 FLG 基因突变引起的,这个疾病的遗传方式是常染色体显性遗传。后代的患病风险是1/2 ...
有哪些好用的医学和生物学的数据库? - 知乎
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这范围太广了,医学和生物学分支超级多超级细,每个分支都有很好用的数据库。如果你的需求描述得更细会更加方便别人推荐。比如遗传病的 OMIM 数据库, 肿瘤 的COSMIC,表型库有HPO, 药物基因组学 的pharmGKB,要查基因可以去genebank,等等。 如果只是大致想了解一下疾病和基因,可以先考虑用 ...
网络药理学疾病靶点预测OMIM数据库? - 知乎
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OMIM数据库中根据疾病名称搜索到的靶点有1000多个,怎样筛选呢?就是类似GeneCards可以根据score值筛选。…
耳聋基因GJB2 235delC和299_300delAT携带者有可能不致病么?
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GJB2引起的耳聋有两种遗传方式, 常染色体隐性遗传 耳聋1A型(OMIM:220290)、 常染色体显性遗传 耳聋3A型(OMIM:601544)。以常隐遗传考虑,如果一个人携带两个突变在遗传上是构成 复合杂合突变,携带复合杂合是否一定致病,还要看这两个位点的致病性和分布频率。
刚接触生物信息二代测序数据分析,看文献学软件学语言,如何不着急? - 知乎
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那不简单,是骡子是马拉出来溜溜不就完啦。 我有一招,学测序分析一星期就上手,做五遍就熟练,做十遍不保你精通,也能保你专业。 首先,你得有一台好一点的电脑,不是笔记本哦,最好是服务器。然后找十篇二代测序和后续分析的文章,一篇讲理论的综述,一篇讲方法的综述。好啦,这就是 ...
大家GeneCard得到的基因得分按照多少筛选呢? - 知乎
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先写结论:单一GeneCards数据库似乎暂未建立统一的基因集筛选标准。如果初步搜索获得的基因过多,可采用其相关性评分(Relevance Score)的中位数进行初步筛选,以快速压缩基因集规模;更优的策略为将其与MSigDB、DisGeNET、OMIM、TTD等权威数据库的基因集,或既往发表的经典研究中验证的核心基因集取 ...
手机动态内存拓展值不值得打开,会不会伤储存? (本人12GB)?
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今天就看到这么一段评论,有网友表示:“内存拓展功能千万别开,说实话这功能很鸡肋,对后台管理提升并不大,而且还会让手机运行变卡。” 对此我的看法是予以反驳,我自己就一直打开这项功能,我能明显感知到区别。 首先,内存拓展功能说白了就叫做“虚拟内存”,这项技术在PC电脑领域 ...